XIV–XV a. ant Merkinės piliakalnio stovėjo viena stipriausių Nemuno gynybinės sistemos lietuvių medinių pilių. Nepaisant to, tyrėjai nustatė, jog mažiausiai tris kartus pilies įgula nuo kryžiuočių neapsigynė. Piliakalnio papėdėje rasta keramika, kokliai ir plytos liudija vietinius žmones kūrus namų jaukumą šioje upių santakoje, o akmeninis patrankos sviedinys mena ir sudaužytus pastatus bei likimus. Vaizdas, atsiveriantis nuo šio piliakalnio, vertinamas kaip vienas gražiausių Lietuvoje. Būtina pamatyti.